萬能轉換：R圖和統計表轉成發表級的Word、PPT、Excel、HTML

能轉換：R圖和統計表轉成發表級的Word、PPT、Excel、HTML、Latex、矢量圖等

R包export可以輕松的將R繪制的圖和統計表輸出到 Microsoft Office (Word、PowerPoint和Excel)、HTML和Latex中，其質量可以直接用于發表。

你和PPT高手之間，就只差一個iSlide
Excel改變了你的基因名，30% 相關Nature文章受影響，NCBI也受波及

特點

可以用命令將交互式R圖或ggplot2、Lattice或base R圖保存到Microsoft Word、Powerpoint或其他各種位圖或矢量格式。
完全可編輯的Powerpoint矢量格式輸出，支持手動整理繪圖布局。
將統計分析的輸出保存為Excel、Word、PowerPoint、Latex或HTML文檔的表格形式。
自定義R輸出格式。

安裝

export包可以在Windows、Ubuntu和Mac上跨平臺運行。不過有些Mac發行版默認情況下沒有安裝cairo設備，需要自行安裝。如果Mac用戶已安裝XQuartz，這個問題就解決了，它可以從https://www.xquartz.org/免費獲得。

官方CRAN發布（以不能用）

install.packages("export")

從 Github 安裝（推薦

install.packages("officer")
install.packages("rvg")
install.packages("openxlsx")
install.packages("ggplot2")
install.packages("flextable")
install.packages("xtable")
install.packages("rgl")
install.packages("stargazer")
install.packages("tikzDevice")
install.packages("xml2")
install.packages("broom")
install.packages("devtools")
devtools::install_github("tomwenseleers/export")

該包主要包括以下幾種轉換

graph2bitmap
graph2office
graph2vector
rgl2bitmap 轉換3D圖
table2office
table2spreadsheet
table2tex
graph2bitmap: 將當前R圖保存到bmp文件中
graph2png: 將當前R圖保存到png文件中
graph2tif: 將當前R圖保存到TIF文件中
graph2jpg: 將當前R圖保存為JPEG文件

使用幫助信息如下：

graph2bitmap(x = NULL, file = "Rplot", fun = NULL, type = c("PNG","JPG", "TIF"),
        aspectr = NULL, width = NULL, height = NULL, dpi = 300,scaling = 100,
        font =ifelse(Sys.info()["sysname"] == "Windows", "Arial",
        "Helvetica")[[1]], bg = "white", cairo = TRUE,
        tiffcompression = c("lzw", "rle", "jpeg", "zip", "lzw+p", "zip+p"),
        jpegquality = 99, ...)

aspectr: 期望縱橫比。如果設置為空，則使用圖形設備的縱橫比。
width: 所需寬度(英寸);可以與期望的縱橫比aspectr組合。
height: 所需高度(英寸);可以與期望的縱橫比aspectr組合。
scaling: 按一定比例縮放寬度和高度。
font: PNG和TIFF輸出中標簽所需的字體; Windows系統默認為Arial，其他系統默認為Helvetica。
bg: 所需的背景顏色，例如“白色”或“透明”。
cairo: 邏輯，指定是否使用Cairographics導出。
tiffcompression: 用于TIF文件的壓縮。
jpegquality: JPEG壓縮的質量。

準備開始

安裝完 export包后，先調用該包

library(export)

用ggplot2繪圖

library(ggplot2)
library(datasets)

x=qplot(Sepal.Length, Petal.Length, data = iris,
        color = Species, size = Petal.Width, alpha = I(0.7))

qplot()的意思是快速作圖，利用它可以很方便的創建各種復雜的圖形，其他系統需要好幾行代碼才能解決的問題，用qplot只需要一行就能完成。

使用半透明的顏色可以有效減少圖形元素重疊的現象，要創建半透明的顏色，可以使用alpha圖形屬性，其值從0（完全透明）到1（完全不透明）。更多ggplot2繪圖見ggplot2高效實用指南 (可視化腳本、工具、套路、配色) （往期教程更有很多生物信息相關的例子）。

鳶尾花(iris)是數據挖掘常用到的一個數據集，包含150個鳶尾花的信息，每50個取自三個鳶尾花種之一（setosa,versicolour或virginica)。每個花的特征用下面的5種屬性描述萼片長度(Sepal.Length)、萼片寬度(Sepal.Width)、花瓣長度(Petal.Length)、花瓣寬度(Petal.Width)、類(Species)。

在console里展示數據圖（長寬比自己調節）：

導出圖形對象

# 需運行上面的ggplot2繪圖
# Create a file name
# 程序會自動加后綴
filen <- "output_filename" # or
# filen <- paste("YOUR_DIR/ggplot")
# There are 3 ways to use graph2bitmap():
### 1. Pass the plot as an object
graph2png(x=x, file=filen, dpi=400, height = 5, aspectr=4)
graph2tif(x=x, file=filen, dpi=400, height = 5, aspectr=4)
graph2jpg(x=x, file=filen, dpi=400, height = 5, aspectr=4)

導出當前繪圖窗口展示的圖

### 2. Get the plot from current screen device
# 注意這個x，是運行命令，展示圖像
x
graph2png(file=filen, dpi=400, height = 5, aspectr=4)
graph2tif(file=filen, dpi=400, height = 5, aspectr=4)
graph2jpg(file=filen, dpi=400, height = 5, aspectr=4)

導出自定義函數輸出的一組圖

### 3. Pass the plot as a functio
plot.fun <- function(){
  print(qplot(Sepal.Length, Petal.Length, data = iris,
              color = Species, size = Petal.Width, alpha = 0.7))
}
graph2png(file=filen, fun=plot.fun, dpi=400, height = 5, aspectr=4)
graph2tif(file=filen, fun=plot.fun, dpi=400, height = 5, aspectr=4)
graph2jpg(file=filen, fun=plot.fun, dpi=400, height = 5, aspectr=4)

轉換后的圖形:

與Office系列的交互

大部分圖的細節修改都是用代碼完成的，不需要后續的修飾；但如果某一些修改比較特異，不具有程序的通用性特征，或實現起來比較困難，就可以考慮后期修改。比如用AI文章用圖的修改和排版。熟悉PPT的，也可以用PPT，這時R的圖導出PPT，就要用到graph2office系列函數了。

graph2ppt: 將當前R圖保存到Microsoft Office PowerPoint/LibreOffice Impress演示文稿中。

graph2doc:將當前的R圖保存到Microsoft Office Word/LibreOffice Writer文檔中。

函數參數展示和解釋

graph2office(x = NULL, file = "Rplot", fun = NULL, type = c("PPT", "DOC"),
        append = FALSE, aspectr = NULL, width = NULL, height = NULL,scaling = 100,
        paper = "auto", orient = ifelse(type[1] == "PPT","landscape", "auto"),
        margins = c(top = 0.5, right = 0.5, bottom = 0.5, left= 0.5),
        center = TRUE, offx = 1, offy = 1, upscale = FALSE, vector.graphic = TRUE, ...)

margins: 預設留白邊距向量。
paper: 紙張尺寸——“A5”至“A1”用于Powerpoint導出，或“A5”至“A3”用于Word輸出;默認“auto”自動選擇適合您的圖形的紙張大小。如果圖太大，無法在給定的紙張大小上顯示，則按比例縮小。
orient: 所需的紙張方向-“自動”，“縱向”或“橫向”; Word輸出默認為“自動”，Powerpoint默認為“橫向”。
vector.graphic: 指定是否以可編輯的向量DrawingML格式輸出。默認值為TRUE，在這種情況下，編輯Powerpoint或Word中的圖形時，可以先對圖形元素進行分組。如果設置為FALSE，則將該圖以300 dpi的分辨率柵格化為PNG位圖格式。(柵(shān)格化,是PS中的一個專業術語,柵格即像素,柵格化即將矢量圖形轉化為位圖。)

同樣有3種導出方式

# 需運行上面的ggplot2繪圖
# Create a file name
filen <- "output_filename" # or
# filen <- paste("YOUR_DIR/ggplot")
# There are 3 ways to use graph2office():
### 1. Pass the plot as an object
# 導出圖形對象
graph2ppt(x=x, file=filen)
graph2doc(x=x, file=filen, aspectr=0.5)
### 2. Get the plot from current screen device
# 導出當前預覽窗口呈現的圖
x
graph2ppt(file=filen, width=9, aspectr=2, append = TRUE)
graph2doc(file=filen, aspectr=1.7, append =TRUE)
### 3. Pass the plot as a function
# 導出自定義函數輸出的一系列圖
graph2ppt(fun=plot.fun, file=filen, aspectr=0.5, append = TRUE)
graph2doc(fun=plot.fun, file=filen, aspectr=0.5, append = TRUE)

導出到office(ppt和word)中的圖形，是可編輯的:

其它導出到ppt的例子（設置長寬比）

graph2ppt(file="ggplot2_plot.pptx", aspectr=1.7)

增加第二張同樣的圖，9英寸寬和A4長寬比的幻燈片 (append=T，追加)

graph2ppt(file="ggplot2_plot.pptx", width=9, aspectr=sqrt(2), append=TRUE)

添加相同圖形的第三張幻燈片，寬度和高度固定

graph2ppt(file="ggplot2_plot.pptx", width=6, height=5, append=TRUE)

禁用矢量化圖像導出

graph2ppt(x=x, file=filen, vector.graphic=FALSE, width=9, aspectr=sqrt(2), append = TRUE)

用圖填滿幻燈片

graph2ppt(x=x, file=filen, margins=0, upscale=TRUE, append=TRUE)

輸出矢量圖

graph2svg: 將當前的R圖保存為SVG格式
graph2pdf: 將當前的R圖保存為PDF格式
graph2eps: 將當前的R圖保存為EPS格式

函數參數解釋

graph2vector(x = NULL, file = "Rplot", fun = NULL, type = "SVG",aspectr = NULL,
        width = NULL, height = NULL, scaling = 100,
        font = ifelse(Sys.info()["sysname"] == "Windows",
        "Arial","Helvetica")[[1]], bg = "white", colormodel = "rgb",
        cairo = TRUE,fallback_resolution = 600, ...)

fallback_resolution: dpi中的分辨率用于柵格化不支持的矢量圖形。

#需運行上面的ggplot2繪圖
# Create a file name
filen <- "output_filename" # or
# filen <- paste("YOUR_DIR/ggplot")
# There are 3 ways to use graph2vector():
### 1. Pass the plot as an object
# 導出圖形對象
graph2svg(x=x, file=filen, aspectr=2, font = "Times New Roman",
          height = 5, bg = "white")
graph2pdf(x=x, file=filen, aspectr=2, font = "Arial",
          height = 5,  bg = "transparent")
graph2eps(x=x, file=filen, aspectr=2, font = "Arial",
          height = 5, bg = "transparent")
# 導出當前預覽窗口呈現的圖
### 2. Get the plot from current screen device
x
graph2svg(file=filen, aspectr=2, font = "Arial",
          height = 5, bg = "transparent")
graph2pdf(file=filen, aspectr=2, font = "Times New Roman",
          height = 5, bg = "white")
graph2eps(file=filen, aspectr=2, font = "Times New Roman",
          height = 5, bg = "white")
# 導出自定義函數輸出的一系列圖
### 3. Pass the plot as a function
graph2svg(file=filen, fun = plot.fun, aspectr=2, font = "Arial",
          height = 5, bg = "transparent")
graph2pdf(file=filen, fun=plot.fun, aspectr=2, font = "Arial",
          height = 5, bg = "transparent")
graph2eps(file=filen, fun=plot.fun, aspectr=2, font = "Arial",
          height = 5, bg = "transparent")

轉換3D圖形

rgl2png: 將當前的rgl 3D圖形保存為PNG格式。

rgl2bitmap(file = "Rplot", type = c("PNG"))

# Create a file name
filen <- tempfile("rgl") # or
# filen <- paste("YOUR_DIR/rgl")
# Generate a 3D plot using 'rgl'
x = y = seq(-10, 10, length = 20)
z = outer(x, y, function(x, y) x^2 + y^2)
rgl::persp3d(x, y, z, col = 'lightblue')
# Save the plot as a png
rgl2png(file = filen)
# Note that omitting 'file' will save in current directory

生成的3D圖形：

將生成的3D圖形保存為PNG格式：

輸出統計結果到表格 table2spreadsheet

table2excel: 導出統計輸出到Microsoft Office Excel/ LibreOffice Calc電子表格中的一個表.
table2csv:將統計輸出以CSV格式導出到表中(“，”表示值分隔，“。”表示小數)
table2csv2: 將統計輸出以CSV格式導出到表中(“;”表示值分隔，”，”表示小數)

table2spreadsheet(x = NULL, file = "Rtable", type = c("XLS", "CSV",
  "CSV2"), append = FALSE, sheetName = "new sheet", digits = 2,
  digitspvals = 2, trim.pval = TRUE, add.rownames = FALSE, ...)

sheetName: 一個字符串，給出創建的新工作表的名稱(僅針對type==”XLS”)。它必須是惟一的(不區分大小寫)，不受文件中任何現有工作表名稱的影響。
digits:除具有p值的列外，要顯示所有列的有效位數的數目。
digitspvals:具有p值的列要顯示的有效位數的數目。

# Create a file name
filen <- "table_aov" # or
# filen <- paste("YOUR_DIR/table_aov")
# Generate ANOVA output
fit=aov(yield ~ block + N * P + K, data = npk) # 'npk' dataset from base 'datasets'
x=summary(fit)
# Save ANOVA table as a CSV
### Option 1: pass output as object
# 輸出對象
table2csv(x=x,file=filen, digits = 1, digitspvals = 3, add.rownames=TRUE)
# 屏幕輸出導出到文件
### Option 2: get output from console
summary(fit)
table2csv(file=filen, digits = 2, digitspvals = 4, add.rownames=TRUE)
# Save ANOVA table as an Excel
# Without formatting of the worksheet
x
table2excel(file=filen, sheetName="aov_noformatting", digits = 1, digitspvals = 3, add.rownames=TRUE)
# 更多參數
# With formatting of the worksheet
table2excel(x=x,file=filen, sheetName="aov_formated", append = TRUE, add.rownames=TRUE, fontName="Arial", fontSize = 14, fontColour = rgb(0.15,0.3,0.75),  border=c("top", "bottom"), fgFill = rgb(0.9,0.9,0.9), halign = "center", valign = "center", textDecoration="italic")

原始數據的表格：

轉換格式之后的，在console中的數據：

文件(csv和excel)中表格數據：

導出為Word中的表，再也不用復制粘貼調格式了 table2office

table2ppt: 導出統計輸出到Microsoft Office PowerPoint/ LibreOffice Impress演示文稿中的表

table2doc: 將統計輸出導出到Microsoft Office Word/ LibreOffice Writer文檔中的表

table2office(x = NULL, file = "Rtable", type = c("PPT", "DOC"),
  append = FALSE, digits = 2, digitspvals = 2, trim.pval = TRUE,
  width = NULL, height = NULL, offx = 1, offy = 1,
  font = ifelse(Sys.info()["sysname"] == "Windows", "Arial",
  "Helvetica")[[1]], pointsize = 12, add.rownames = FALSE)

# Create a file name
filen <- "table_aov"
# filen <- paste("YOUR_DIR/table_aov")
# Generate ANOVA output
fit=aov(yield ~ block + N * P + K, data = npk) # 'npk' dataset from base 'datasets'
# Save ANOVA table as a PPT
### Option 1: pass output as object
x=summary(fit)
table2ppt(x=x,file=filen, digits = 1, digitspvals = 3, add.rownames =TRUE)
### Option 2: get output from console
summary(fit)
table2ppt(x=x,file=filen, width=5, font="Times New Roman", pointsize=14, digits=4, digitspvals=1, append=TRUE, add.rownames =TRUE) # append table to previous slide
# Save ANOVA table as a DOC file
table2doc(x=x,file=filen, digits = 1, digitspvals = 3, add.rownames =TRUE)
summary(fit)
table2doc(file=filen, width=3.5, font="Times New Roman", pointsize=14,  digits=4, digitspvals=1, append=TRUE, add.rownames =TRUE) # append table at end of document

將表格數據導出到ppt和word中：

table2tex

table2html: 導出統計輸出到HTML表。

table2tex(x = NULL, file = "Rtable", type = "TEX", digits = 2,
  digitspvals = 2, trim.pval = TRUE, summary = FALSE, standAlone = TRUE,
  add.rownames = FALSE, ...)

summary:是否匯總數據文件。

standAlone:導出的Latex代碼應該是獨立可編譯的，還是應該粘貼到另一個文檔中。

add.rownames:是否應該將行名添加到表中(在第一列之前插入一列)。

# Create a file name
filen <- tempfile(pattern = "table_aov") # or
# filen <- paste("YOUR_DIR/table_aov")
# Generate ANOVA output
fit=aov(yield ~ block + N * P + K, data = npk) # 'npk' dataset from base 'datasets'
x=summary(fit)
# Export to Latex in standAlone format
table2tex(x=x,file=filen,add.rownames = TRUE)
# Export to Latex to paste in tex document
summary(fit) # get output from the console
table2tex(file=filen, standAlone = FALSE,add.rownames = TRUE)
# Export to HTML
table2html(x=x,file=filen) # or
summary(fit) # get output from the console
table2html(file=filen,add.rownames = TRUE)

導出到html或tex中的表格數據：

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繪圖相關系數矩陣corrplot
相關矩陣可視化ggcorrplot
繪制交互式圖形recharts
交互式可視化CanvasXpress
聚類分析factoextra
LDA分析、作圖及添加置信-ggord
解決散點圖樣品標簽重疊ggrepel
添加P值或顯著性標記ggpubr
Alpha多樣性稀釋曲線rarefraction curve
堆疊柱狀圖各成分連線畫法：突出組間變化
沖擊圖展示組間時間序列變化ggalluvial
桑基圖riverplot
微生物環境因子分析ggvegan
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多元回歸樹分析mvpart
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wf 是國外某公司的動畫設計軟件 Flash 專用格式。白話一點，swf 文件是 Flash 軟件或者 animate 軟件導出時的一種特殊的視頻格式，最常應用的場景是網頁 html 設計中，現在用得不多。

所以很多軟件不兼容此格式，無法播放這類格式的視頻。下面小編教大家三種方法將 swf 格式轉換成 mp4 格式。

方法1：視頻轉碼軟件

推薦指數：☆☆☆☆☆

目前市面上有各種各樣的視頻轉碼軟件，既有付費的，也有免費的工具，無論是付費還是免費的，小編覺得最主要的是能否轉換，轉換之后是否會影響到視頻的質量，如視頻分辨率、音視頻是否同步等。下面以野蔥視頻轉換器為例，為大家講解一下。

這是一款多功能的視頻格式轉換軟件，它支持各種格式的視頻音頻文件轉換，并且操作簡單，即使是零基礎的電腦小白也能夠在短時間內學會操作，快速上手！下面就讓我們來看看該軟件具備什么特色吧！

1、支持豐富的文件格式

MP4、AVI、MKV、FLV、WMV、M4V、MOV等上百種視頻格式，并且支持自定義分辨率，如1080P、720P、4K等；

2、操作簡單、轉換效率高

借助這款工具如何實現格式轉換？四步操作就能夠幫你搞定：【選擇功能-上傳文件-設置參數-轉換完成】。另外這款軟件還支持批量轉換，能夠一次上傳多個視頻進行轉換操作，提高效率的同時也節省了不少時間。

3、功能豐富

除了視頻格式轉換之外，它還支持視頻分割合并、視頻轉GIF、視頻水印、視頻優化、視頻壓縮等功能。經常需要編輯視頻文件的小伙伴們有福了，用它就能夠實現很多操作哦！

方法2：在線視頻轉換網站

推薦指數：☆☆☆

有一些小伙伴覺得電腦操作比較麻煩，目前市面上同樣有一些視頻轉碼的平臺可以在線處理，只是多數是國外的網站，可以轉換速度比較慢。

步驟 1：瀏覽器打開 Online-Convert，選擇對應的功能；

步驟 2：點擊中間那個云朵的箭頭，上傳需要轉換的視頻文件，下方是一些參數的設置，大家可以根據自己的需求選擇對應的參數；

步驟 3：視頻轉換完成后，會自動保存到本地，一般會在本地的「下載」中。

方法3：VLC media Player

推薦指數：☆☆☆

VLC media Player 是一款國外的開源跨平臺多媒體播放器，可以兼容絕大多數市面上的視頻文件格式，由于存在一定技術門檻，所以不太適合小白用戶。

步驟 1：運行軟件 VLC media Player，進入軟件后點擊「Media」-「Convert/Save」；

步驟 2：點擊右側的「add」按鈕添加需要轉換的視頻文件，上傳成功后，左側的界面內會羅列出相關的視頻信息；

步驟 3：添加成功后設置好輸出格式、存儲路徑等相關參數，點擊「Start」即轉換。

以上就是分享給大家的「swf怎么轉換成mp4格式」三種方法，以及詳細的swf轉換成mp4的詳細操作步驟，你們都學會了嗎~

么把swf文件轉換mp4？小編在百度百科上看到的解釋是，swf 是國外公司的動畫設計軟件 Flash 專用格式。說白了就是，swf文件是Flash軟件或者 animate軟件導出時的一種視頻格式，常用場景是再網頁html設計中，這是一種專屬于動畫設計的格式，對于經常在網頁設計這塊的小伙伴們來說應該最為熟悉了。想要打開swf格式就必須在瀏覽器中裝上flash插件才能進行播放，對于非設計專業的小伙伴們使用起來就不是很熟悉了，會顯得很麻煩。

swf是一種flash動畫生成格式，所以很多軟件不兼容此格式，無法播放這類格式的視頻。有時電腦里面如果沒有安裝相關的插件也無法打開。所以在這里面有個方法就是將swf格式轉換成常用的MP4，mp4格式兼容性也比較好，我們使用起來會更方便一些，這樣在工作和學習中使用起來就沒有那么復雜了，如何將swf轉換成mp4呢，小編給小伙伴們分享了一種好用的轉換方法，下面讓我們來看看詳細的使用步驟。

swf轉mp4需借助工具：優速視頻處理大師

工具下載地址：https://download.yososoft.com/YSVideos/YSVideos_TTY.exe

swf轉換mp4格式的操作：

步驟1、打開電腦中的軟件“優速視頻處理大師”，在首頁面中選擇所要用到的【格式轉換】功能。如果大家電腦上沒有這款軟件，就需要我們去下載并安裝一下

步驟2、然后點擊【添加文件】按鈕，選擇需要轉換的swf視頻文件上傳到軟件中，當然也可以用鼠標直接將其拖拽到軟件中，軟件支持批量格式轉換，對上傳的文件個數不限制。

步驟3、文件上傳完成后，在右側格式下拉框中將轉換后的視頻格式選擇成為MP4，接著設置輸出目錄，用來保存轉換好的MP4文件。

步驟4、上述設置妥當后，點擊【開始轉換】按鈕，這樣軟件就開啟了格式轉換功能。并在轉換結束后自動彈出輸出文件夾，方便用戶查看文件。

步驟5、最后我們將轉換前后的視頻文件進行對比，如下圖所示，很明顯看到上傳時的swf文件變成了現在的MP4視頻文件，那說明軟件轉換很成功。

以上就是swf怎么轉換成mp4的全部操作過程了，是不是很簡單學起來也很方便，通過上面的這幾個步驟，很快捷地就能將視頻的格式進行轉換，既簡單又方便，節省了我們很多時間，大家有需求的也可以去試一試。好了我們下期再見！

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